Před rekonstrukcí v r. 1975 bylo toto muzeum uzavřeno a přestěhováno do depozitu. V roce 1997 bylo muzeum opětovně otevřeno.
Při prohlídce muzea absolvují návštěvníci i prohlídkovou trasu interiérů hradu. V muzeu může návštěvník shlédnout vedle střelných zbraní, trofejí z poznávacích cest bývalých majitelů hradu, archeologických vykopávek z období 3tis. let p.n.l. také alchymistickou dílnu, která je instalována v prostorách, kde se alchymistické i jiné pokusy v 16. stol. prováděly. Ojedinělá expozice alchymistické dílny obsahuje vedle prvků a součástí alchymisty používanými také ukázku laboratoře s celou řadou pecí, pícek, kahanů, díží a receptů na výrobu všeho o co se alchymisté v minulosti pokoušeli.
Při návštěvě vodního hradu mohou návštěvníci vidět zdařilou vycpaninu nilského krokodýla, který byl na budyňské panství přivezen v začátku 16. stol. Expozice muzea i prohlídková trasa je zpřístupněna celoročně. V zimním období pro více než 10 osob telefonicky.
